En la primavera de 2017, se confirmó la presencia de crías de cormorán moñudo, un ave propia de Europa y zonas limítrofes del norte de África y oriente próximo. Es una especie catalogada como vulnerable. Se identificaron en las islas de San Pedro un total de siete nidos ocupados, cuatro de ellos con crías. Solo este hecho justificaría la necesaria protección del archipiélago, según el Concello. También destaca la presencia del arao común, en peligro de extinción; el halcón peregrino, en la lista roja de especies amenazadas, la pardela pichoneta y el ostrero euroasiático, catalogado como vulnerable.
